共济失调毛细血管扩张突变基因功能缺失在不同肿瘤类型中呈现变异与组织特异性差异

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目的:ATM 基因突变在多种癌症中普遍存在,但靶向 ATM 异常肿瘤的治疗性临床研究结果并不一致。亟需进一步完善 ATM 功能缺失(LOF)作为疗效预测生物标志物的定义。实验设计:我们首次公开报道了新型选择性 ATR 抑制剂 ART0380 的临床前开发工作,并在多种临床前肿瘤模型中检测其抗肿瘤活性。为完善 ATM LOF 作为预测性生物标志物,我们对患者肿瘤中的 ATM 变异进行了全面的泛癌分析,随后评估了 ATM 变异与蛋白表达之间的关系。最后,我们在接受铂类化疗或 ATR 抑制治疗患者的回顾性临床数据集中,评估了一种新的 ATM LOF 生物标志物策略。结果:ART0380 在多种具有不同程度 ATM LOF 的临床前肿瘤模型中表现出强效、选择性的抗肿瘤活性。泛癌分析在 8,587 例患者肿瘤中共鉴定出 10,609 个 ATM 变异。在有害变异(Tier 1)与未知/良性变异(Tier 2)的占比、杂合性缺失的选择压力,以及有害变异与 ATM 蛋白缺失(LOP)之间的一致性方面,均观察到癌种特异性差异。一种新的 ATM LOF 生物标志物策略——综合考虑变异分类、与 ATM LOP 的关系以及组织特异性外显率——可显著富集从铂类化疗或 ATR 抑制治疗中获益的患者。结论:这些数据有助于更准确地界定不同肿瘤类型中的 ATM LOF,从而优化患者筛选,并改进针对 ATM LOF 肿瘤患者的分子靶向治疗策略。

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